[VIP第1年] 指数:3
染色体STR不属于测序技术的，它是一类分子检测技术，例如Y染色体-STR，一般通过PCR，重庆一体化迈杰转化医学NGS平台诚信合作、电泳凝胶结合来分析这段串联重复序列的存在或者多态性，常用来检测性别或亲子鉴定，而不能测出具体的DNA序列信息。测序技术是一代测序（sanger测序）、二代测序（高通量测序）、三代测序（单分子测序）为基础的。二代测序的缺点主要是由其PCR边复制边读取的原理决定的，测序时间长，读长短，末端质量差。三代测序中PacBio实际上就是针对这些缺点的升级，重庆一体化迈杰转化医学NGS平台诚信合作，重庆一体化迈杰转化医学NGS平台诚信合作，通过巧妙的微孔设计实现单分子读取，而且可以屏蔽游离dNTP的信号，不用每读取一次就要清洗—添加一次dNTP，所以读长比较长，测序速度快。 MLH1抗体试剂 苏苏械备20180519号.重庆一体化迈杰转化医学NGS平台诚信合作
2、IlluminaSolexa测序方法：由Solexa公司开发，2006年发布，于2007年被Illumina收购，并将测序仪命名商品化为IlluminaGenomeAnalyzer（简称GA）；Illumina不断升级GA，特别是HiSeq系列测序仪的研发完成，由此打破了***的“摩尔定律”。基本流程：（1）构建测序文库。提取基因组DNA，随机打断成100-200bp片段，末端加上接头；（2）桥式扩增。解链后的单链DN**段两端被分别固定于芯片上，形成桥状结构，进行桥式PCR扩增。经过PCR扩增，产生数百万条待测的DN**段，随后被线性化；（3）测序。将荧光标记的dNTP、聚合酶、引物加入到测序通道启动测序循环。DNA合成时，伴随着碱基的加入会有焦磷酸被释放，从而发出荧光，不同碱基用不同荧光标记，读取到核苷酸发出的荧光后，将3羟基末端切割，随后加入第2个核苷酸，重复***个核苷酸的步骤，直到模板序列全部被合成双链DNA。Illumina现有二代测序平台：MiSeq、HiSeq2500(1000G)、HiSeq3000、HiSeq4000、NextSeq500、HiSeqX10(10台HiSeq2500并行)、HiSeqXFive。 重庆一体化迈杰转化医学NGS平台诚信合作迈杰转化医学为客户提供生物标记物发现、 靶点验证、伴随诊断开发与商业化、患者用药指导等一体化解决方案。
h1)str分型；(h2)y-str分型；(h3)个体识别；(h4)亲权鉴定；(h5)种族推断。本发明还保护上述任一所述引物组合或上述任一所述复合扩增体系的应用，可为(h1)-(h5)中的至少一种：(h1)str分型；(h2)y-str分型；(h3)个体识别；(h4)亲权鉴定；(h5)种族推断。上述任一所述68个基因座具体可由amelogenin、dys19、dys385a/b、dyf387s1a/b、dys388、dys389-i、dys389-ii、dys390、dys391、dys392、dys393、dyf399s1、dyf404s1a/b、dys437、dys438、dys439、dys443、dys444、dys446、dys447、dys448、dys449、dys456、dys458、dys459a/b、dys460、dys481、dys485、dys504、dys505、dys508、dys510、dys518、dys520、dys522、dys527a/b、dys531、dys533、dys549、dys552、dys557、dys570、dys576、dys587、dys593、dys596、dys612、dys617、dys622、dys626、dys627、dys630、dys635、dys641、dys643、dys644、dys645、dys710、dys720、y-gata-a10和y-gata-h4组成。其中，amelogenin为性别决定基因座。dyf399s1包含三个分型片段。dys385a/b、dyf387s1a/b、dyf404s1a/b、dys459a/b和dys527a/b均包含两个分型片段。本发明提供的试剂盒可以检测68个基因座。
实施例3、实施例1制备的试剂盒的准确性验证1、取1ng标准品2800m、样本一、样本二或样本三(见实施例2中步骤二)，按照yfilerpluspcramplifcationkit(thermofisherscientific)的说明书步骤进行毛细管电泳检测，得到各个基因座的等位基因基因型。分型结果见表4。表4注：m为毛细管电泳检测技术的分型结果，e为二代测序技术的分型结果。2、按照实施例2中步骤一的方法检测标准品2800m、样本一、样本二或样本三，得到各个基因座的等位基因基因型。分型结果见表4。结果表明，实施例1制备的试剂盒与yfilerpluspcramplifcationkit重合的基因座，在标准品2800m、样本一、样本二和样本三中的分型结果完全一致。实施例4、实施例1制备的试剂盒中引物具有不可替换性实施例1制备的试剂盒是本发明的发明人经过大量实验获得的，主要包括扩增各个基因座引物的反复调试和引物浓度的摸索。由于复合的基因座数目较多，引物间相互抑制情况复杂，所以试剂盒中用于扩增各个基因座的引物不可替换。1、设计并合成表5中第2列所示的、用于扩增65个str基因座的引物，然后混合，获得引物混合物1。设计并合成表5中第4列所示的、用于扩增66个str基因座的引物，然后混合，获得引物混合物2。方法简单易行，医保覆盖，适于临床推广。
PacBio平台技术关键DNA聚合酶，该技术得到的序列读长主要跟DNA聚合酶的活性有关，它主要受激光对其造成的损伤所影响。荧光基团标记在核苷酸3'端磷酸上，在DNA合成过程中，3'端的磷酸键随着DNA链的延伸被断开，标记物被弃去，减少了DNA合成的空间位阻，维持DNA链连续合成，延长了测序读长。ZMW(零模波导孔)，将反应信号与周围游离碱基的强大荧光背景进行区分，在一个反应管中有许多这样的圆形纳米小孔，其外径*有100nm，激光从底部打出后不能穿透小孔进入上方溶液区，能量被限制在一个小范围里，使得荧光信号*来自这个小反应区域，孔外其它游离核苷酸单体依然留在黑暗中，从而实现将背景荧光降到比较低。PacBio平台技术优势1.近乎完美的一致性和准确性三代测序单碱基错误率虽然很高，但是这种单碱基的错误是随机发生的，因此，对同一段序列测序覆盖多次就能够进行纠错，一般覆盖到10X以上的深度就能达到。2.不存在测序的偏好性因为SMRT技术在样本制备时无需PCR扩增，对于某些具有极端的碱基组成的核酸区域，三代测序也是无偏好性的，同时也不受回文序列的影响。3.序列准确比对二代测序得到的序列由于长度不够，在进行比对时，会出现很多错误匹配，从而造成假阳性SNP位点。 迈杰转化医学针对药物研发过程中靶点、适应症及PD研究中生物标志物等研究的进行方案开发设计。吉林Claudin18.2迈杰转化医学NGS平台共同合作
迈杰转化医学致力于解决创新药物的研发痛点及患者的用药痛点，助力精z准医疗！重庆一体化迈杰转化医学NGS平台诚信合作
67个y-str基因座分别为：dys19、dys385a/b、dyf387s1a/b、dys388、dys389-i、dys389-ii、dys390、dys391、dys392、dys393、dyf399s1、dyf404s1a/b、dys437、dys438、dys439、dys443、dys444、dys446、dys447、dys448、dys449、dys456、dys458、dys459a/b、dys460、dys481、dys485、dys504、dys505、dys508、dys510、dys518、dys520、dys522、dys527a/b、dys531、dys533、dys549、dys552、dys557、dys570、dys576、dys587、dys593、dys596、dys612、dys617、dys622、dys626、dys627、dys630、dys635、dys641、dys643、dys644、dys645、dys710、dys720、y-gata-a10、y-gata-h4；其中，dys385a/b、dyf387s1a/b、dyf404s1a/b、dys459a/b、dys527a/b分别包含两个分型片段，dyf399s1包含三个分型片段。二、引物组合的制备1、人工设计并合成用于扩增每个基因座的引物(要求扩增长度**好300bp以下)，然后进行pcr扩增，获得每个基因座的特异性扩增产物。2、综合单个基因座的扩增条件，选择适宜扩增程序，进行复合扩增。由于复合的基因座数目较多，引物间相互抑制情况复杂，所以需要一一排除，找出这些基因座，重新设计并合成引物。此外，不同基因座的引物之间还会形成引物二聚体。 重庆一体化迈杰转化医学NGS平台诚信合作
公司拥有国际前列的产品开发团队及完善的产品研发流程，与全球药企展开伴随诊断产品的开发合作，目前，公司已有多个诊断产品上市，另有数个伴随诊断产品已进入临床试验或申报阶段。
迈杰转化医学注重质量体系的建立，拥有StarLIMS实验室信息化管理系统，中心实验室获得了中国CNAS ISO 17025 国际实验室认可、美国CAP认证。在产品研发及商业化上，公司拥有GSP证书、获得了欧盟ISO 13485质量认证并通过了国家医疗器械GMP稽查。公司同时与国内外药企、诊断公司及检测平台公司等发起成立了中国医疗与伴随诊断专业委员会（中国生物工程学会下属），旨在推动中国医疗及伴随诊断事业健康发展。迈杰转化医学已然成为中国医疗中诊断整体解决方案的开拓者。
文章来源地址: http://yyby.m.chanpin818.com/yiliaoqiju/qtylqj/deta_15964030.html
免责声明： 本页面所展现的信息及其他相关推荐信息，均来源于其对应的用户，本网对此不承担任何保证责任。如涉及作品内容、 版权和其他问题，请及时与本网联系，我们将核实后进行删除，本网站对此声明具有最终解释权。
