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咽拭子除了用于核酸检测还可以用在急性化脓性扁桃体炎、急性咽喉炎、白喉等呼吸疾病。主要操作方法是取出分泌物后，进行相应的实验室检查，可得知患者主要以哪种细菌为主，医生会根据培养细菌的药敏结果作为临床用药的重要依据。因此，对于上述疾病的诊断，咽拭子检查是非常有必要的。患者在接受咽拭子检查时，可能会出现轻度的神经反射，但大部分人可以耐受。白喉、急性化脓性扁桃体炎、急性咽喉炎等疾病常用咽拭子检查。咽拭子检查是取咽喉部的分泌物，进行细菌培养，然后再根据细菌进行药敏试验。咽拭子检查的结果可以为临床医生的准确用药提供重要的依据。
冠状病毒核酸检测结果是冠状肺炎诊断和疗效评价的重要参考，核酸检测筛查标本多来源于深咳痰液或者咽拭子，而咽拭子可以分为鼻咽拭子和口咽拭子。咽拭子核酸检测标本采集的关键是什么？无论是采集鼻咽拭子还是口咽拭子，采集深度是关键，比如采集鼻咽拭子没有采到鼻腔深处，可能采集到的细胞绝大部分都是不含病毒的细胞，即可能造成“假阴性”。两者有何不同？咽部分区包括鼻咽、口咽、喉咽，三者的黏膜是连续的，均属于上呼吸道的区域，鼻咽拭子和口咽拭子只是取样的路径不一样，经口取样是口咽拭子，经鼻取样为鼻咽拭子。
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